照常進行修業之旅的小智（松本梨香 配音）、小剛（上田祐司 配音）、小霞（飯塚雅弓 配音）一行輾轉來到水之都奧多馬雷參加緊張刺激的水上競賽。奧多馬雷流傳著一個精彩的傳說，在很久很久以前，島上的老夫婦撿到一對孤兒兄妹，當邪魔出現時，兩兄妹化作威力強大的神奇寶貝拉帝歐斯和拉帝亞斯，他們擊敗邪魔，并賜予奧多馬雷人民名為“心靈水滴”的寶石作為守護。時至今日，神圣的心靈之滴卻引起一對盜賊姐妹（釋由美子 配音）...

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正準備獲得帝都大學的物理學教授的湯川學（福山雅治 飾）是一名不折不扣的物理學怪才，思維異于常人。這日，女警內海薰（柴崎幸 飾）接手了一單離奇的人體自燃案件，毫無頭緒卻又急于破案的她在同事草薙俊平的介紹下，找到了湯川學。湯川學本來不想惹麻煩上身，后來經不起內海薰的糾纏，終于答應和她攜手破案。在經過一系列取證后，湯川學運用他精深的物理學知識，終于揭破了罪犯的犯罪手法，幫助警方順利破案。 　　一日，內海...