晴朗時節，江戶川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小蘭（山崎和佳奈 配音）以及少年偵探團的伙伴們一同來到京都，他們即將登上自衛隊的宙斯盾戰艦，體驗一把出海作戰的感覺，期間還結識了美麗又有著幾分神秘的女自衛隊員藤井七海（柴咲幸 配音）。誰知快樂的氛圍很快被恐慌所替代，戰艦上突然發現一條斷掉的手臂，消失的自衛隊員又引起軍方的恐慌與猜測。原來某國神秘間諜X已悄悄登上宙斯盾，伺機盜取戰艦...

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很多人一定還記得這首歌“美琪和她媽媽到山上去，發生一件事情很稀奇，她們遇到一只黃色的小野貓，跟著他們不離去……”隨著這部動畫的熱播，這首主題曲也廣為流傳。歌詞的內容即可概括故事的劇情。小學一年級的木葉美琪和爸爸媽媽到山上去玩，在樹林里，意外發現了一只橘色長尾巴的貍貓。小貍貓長得很可愛，又無家可歸，于是美琪一家把貍貓帶回了家，把她命名為“叮當貓”。叮當貓會施展各種法術，惹出了不少有趣的故事，帶給大家...